學(xué)校黨委高屋建瓴、準(zhǔn)確研判國(guó)內(nèi)外高等教育形勢(shì)和行業(yè)需求，狠抓辦學(xué)質(zhì)量，各項(xiàng)事業(yè)呈現(xiàn)出快速協(xié)調(diào)發(fā)展的良好態(tài)勢(shì)。2002年，學(xué)校招生規(guī)模逐步穩(wěn)定，著力貫徹“質(zhì)量、結(jié)構(gòu)、特色、效益”八字方針，將抓質(zhì)量提升作為學(xué)校達(dá)到萬人規(guī)模之后的關(guān)鍵任務(wù)。學(xué)校黨委深入剖析學(xué)校以往辦學(xué)過程之中出現(xiàn)的矛盾和問題，2004年上半年在全校范圍內(nèi)發(fā)起了“落實(shí)科學(xué)發(fā)展觀，加快學(xué)校改革發(fā)展步伐”的大討論，全校教職員工在一個(gè)月的時(shí)間內(nèi)共提出了108條建議和意見，使得全校上下的思想得到了進(jìn)一步的統(tǒng)一，為加快學(xué)校改革奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

同年，為進(jìn)一步完善學(xué)校的發(fā)展戰(zhàn)略規(guī)劃，學(xué)校在邀請(qǐng)校內(nèi)外14位院士對(duì)學(xué)校把關(guān)的基礎(chǔ)上，發(fā)動(dòng)有關(guān)職能部門和各學(xué)院開展討論，再一次豐富完善學(xué)校發(fā)展戰(zhàn)略規(guī)劃，并且于2005年組織制定了《北京林業(yè)大學(xué)中長(zhǎng)期發(fā)展規(guī)劃（2006-2020）》。為學(xué)校提出“三步走”的戰(zhàn)略構(gòu)想搭建了思想基礎(chǔ)。

在2005年召開的第九次黨代會(huì)上，學(xué)校黨委從三個(gè)代表的重要思想高度，重新分析國(guó)家、高等教育和行業(yè)需求，明確了總體發(fā)展目標(biāo)，正式提出了“三步走”的戰(zhàn)略構(gòu)想，這對(duì)今后的辦學(xué)起到了重要的推動(dòng)作用。

第一步，從2004年到2010年：重點(diǎn)提高本科生和研究生培養(yǎng)質(zhì)量，成為本科教學(xué)工作優(yōu)秀學(xué)校，積極擴(kuò)大研究生教育規(guī)模，逐步提高研本比；建好特色學(xué)科，保證一般學(xué)科，發(fā)展新興學(xué)科，爭(zhēng)取新上2-3個(gè)國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科，取得國(guó)家級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室建設(shè)的突破，力爭(zhēng)6個(gè)左右特色學(xué)科在國(guó)內(nèi)領(lǐng)先，1-2個(gè)特色學(xué)科達(dá)到或接近國(guó)際領(lǐng)先水平；出幾個(gè)有重大影響的標(biāo)志性科研成果；學(xué)校辦學(xué)條件有較大改善，綜合辦學(xué)實(shí)力有較快提高，實(shí)現(xiàn)從教學(xué)研究型大學(xué)向研究教學(xué)型大學(xué)的轉(zhuǎn)變。

第二步，從2011年到2015年：建成國(guó)內(nèi)高水平的研究生院，積極培養(yǎng)以研究生為主的高層次創(chuàng)新性人才；國(guó)家級(jí)重點(diǎn)學(xué)科力爭(zhēng)達(dá)到國(guó)際領(lǐng)先水平，積極培育新的學(xué)科增長(zhǎng)點(diǎn)，推出一批國(guó)際領(lǐng)先的科研成果，爭(zhēng)取新上國(guó)家級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；形成一支學(xué)術(shù)實(shí)力強(qiáng)大的師資隊(duì)伍。綜合辦學(xué)實(shí)力居國(guó)內(nèi)農(nóng)林院校前列。實(shí)現(xiàn)從研究教學(xué)型大學(xué)向研究型大學(xué)的轉(zhuǎn)變。

第三步，從2016到2020年：在突出特色學(xué)科和重點(diǎn)學(xué)科的基礎(chǔ)上，進(jìn)一步優(yōu)化學(xué)科布局，建成門類較為齊全、特色鮮明、優(yōu)勢(shì)突出的多學(xué)科體系；建成國(guó)內(nèi)規(guī)模最大、水平最高的林科研究生創(chuàng)新人才培養(yǎng)基地，可持續(xù)發(fā)展能力顯著增強(qiáng)。初步實(shí)現(xiàn)將學(xué)校建設(shè)成為國(guó)際知名、國(guó)內(nèi)高水平的多科性、研究型大學(xué)的目標(biāo)。

為了順應(yīng)時(shí)代的需求，學(xué)校在“十一五”期間，主動(dòng)融入國(guó)家生態(tài)文明戰(zhàn)略大局，走特色發(fā)展之路。提出建設(shè)高水平林業(yè)大學(xué)、引領(lǐng)生態(tài)文明的發(fā)展方向，明確優(yōu)先發(fā)展林木等可再生資源培育、生態(tài)系統(tǒng)保護(hù)與恢復(fù)、水土保持與荒漠化防治、園林與城鄉(xiāng)人居環(huán)境安全、生物質(zhì)材料及能源、生態(tài)文化等六大重點(diǎn)領(lǐng)域，并通過積累長(zhǎng)期的辦學(xué)經(jīng)驗(yàn)，凝練形成“知山知水，樹木樹人”的辦學(xué)理念。

2011年7月，學(xué)校成功召開第十屆黨代會(huì)，準(zhǔn)確把握“十二五”時(shí)期機(jī)遇，加快戰(zhàn)略轉(zhuǎn)型，提出未來五年的辦學(xué)指導(dǎo)思想，即“堅(jiān)持用科學(xué)發(fā)展觀統(tǒng)領(lǐng)全局，全面貫徹國(guó)家中長(zhǎng)期教育、科技和人才發(fā)展規(guī)劃綱要，弘揚(yáng)“知山知水、樹木樹人”的辦學(xué)理念，制定實(shí)施學(xué)校“十二五”事業(yè)發(fā)展規(guī)劃，以創(chuàng)新人才培養(yǎng)為根本，以學(xué)科建設(shè)為龍頭，以人才隊(duì)伍建設(shè)為突破，以體制機(jī)制改革為動(dòng)力，以條件建設(shè)為支撐，以加強(qiáng)黨建和思想政治工作為保障，強(qiáng)化辦學(xué)特色，全面提升辦學(xué)水平，初步完成向研究型大學(xué)的轉(zhuǎn)型。”（A19）