福建生物工程職業技術學院是經省委、省政府批準并報國家教育部同意設立，是全省唯一一所醫藥、生物類全日制國家公辦高等大專院校，現隸屬于福建省食品藥品監督管理局，業務由國家教育行政主管部門指導。學院地處福建省福州市區的閩江之畔、洪山橋旁，環境優美，交通便捷，學習、生活設施配套齊全。學生畢業時頒發國家統一的普通高等學校畢業證書。
學院現占地150多畝（新校區將征地308畝），設有7個系11個專業，設置有省級精品專業和精品課程。各類在校生近5000人。學院擁有一支作風優良、業務過硬、比例均衡、結構合理的教師隊伍，在現有的教師隊伍中，具有“雙師型”的教師占45%。另外還從省內的有關高校、企事業單位中長期聘請在醫藥、生物、食品等專業技術上有造詣的專家、教授到我校任教。
學院教學實驗實訓儀器先進，建有能滿足各專業、學科實驗教學需求的三十五個專業實驗室；擁有校園快速寬帶計算機局域網、多功能學術報告廳、衛星有線電視電教中心、無線自動外語播收系統、多媒體演示教室、圖書館、電子閱覽室等；建有藥品生產GMP教學實驗廠、食品保健品調制實驗場、中藥飲片加工實驗場、全省一流品種齊全的中藥標本館、武夷山齊云峰自然博物園中藥種植基地以及三家已通過GSP認證的校辦企業——福建省閩藥經濟開發公司、福建金山醫藥超市和福建醫藥學校耀效醫藥商店以及福建省藥品檢驗所、福州制藥廠、南京軍區福州總院、廈門醫藥有限公司、福州同春藥業股份有限公司等學生實習、實訓基地。
學院設有國家職業技能鑒定站，實行“雙證制”（即畢業證書和職業技能證書），注重學生的綜合素質教育，充分發揮醫藥生物辦學特色。學院堅持“發展創新”的辦學理念，“用發展的眼光看待學生，用創新的意識培養人才”，進一步拓寬辦學路子，開展多層次、多渠道多形式辦學。現有自辦成人大專，并與省內外知名本科大學聯辦本科函授學歷教育，聯辦生物工程專業、中草藥專業碩士研究生學歷教育教學站。開通了“專升本直通車”，形成了較為完善的普通教育與繼續教育相銜接的“立交橋”教育體系，不斷提高教學質量和辦學效益，為海峽西岸經濟區的建設和發展培養應用型、技能型高素質人才和“現場藥師”、“現場工程師”。學院已經逐步建立起國家獎學金、國家助學獎學金、國家勤學獎貸款、國家助學貸款、學院獎學金、勤工助學金、減免緩學費、學院春蕾助學金等多種形式，金額發放有每年8000元、5000元、3000元、1500元、1000元、500元等不同檔次，并開辟了貧困生入學綠色通道，確保每位貧困生不因經濟困難而失學。學院與省內外150多家食品、醫藥、生物等工商企事業單位建立良好的實習就業合作關系，就業渠道寬敞，畢業生就業率連續多年保持在98%以上。歷年來已培養高、中級專門人才一萬多名，許多畢業生已成為省內外食品藥品監督管理系統和醫藥衛生工商企事業單位的專業骨干，在社會中享有較高聲譽。